
藏在组织里的秘密:10x空间多组学透视多发性骨髓瘤免疫图谱
本研究通过整合Visium HD、Xenium和scRNA-seq三大技术平台,首次在空间层面精准定位了多发性骨髓瘤中非经典Wnt信号异常激活,揭示了浆细胞密集区中非经典Wnt通路与T细胞耗竭的耦联机制,并构建了具有临床价值的15个基因标志物。
汇集10x Genomics与PacBio产品在肿瘤、免疫、神经等领域的最新科研文献

本研究通过整合Visium HD、Xenium和scRNA-seq三大技术平台,首次在空间层面精准定位了多发性骨髓瘤中非经典Wnt信号异常激活,揭示了浆细胞密集区中非经典Wnt通路与T细胞耗竭的耦联机制,并构建了具有临床价值的15个基因标志物。

密苏里大学堪萨斯城医学院的研究团队使用HiFi长读长测序(long-read sequencing, lrSeq)验证了其在儿童白血病SV检测中的临床诊断潜力。

研究团队使用Ribo-STAMP技术结合长读长单细胞RNA测序,首次绘制出小鼠海马体单细胞isoform水平的翻译组图谱,不仅解析了单细胞中转录本异构体的翻译调控特征,还揭示了CA1和CA3神经元间的翻译效率差异及分子机制,为理解脑生理与疾病的翻译调控基础提供了全新视角和重要工具。

文章使用基于PacBio HiFi优化的长读长RNA测序,研究了TDP-43相关隐性剪接异构体以及转座子通过隐性剪接“外显子化”,插入基因转录本形成基因-转座子融合转录本(crypTEs)等剪接事件,揭示了TE失调影响ALS的新机制。

在使用单细胞测序研究血液肿瘤时,研究人员常面临一个问题:恶性肿瘤细胞与正常细胞在样本中毗邻共存,要精准解析恶性克隆,需要同时获取单细胞的转录组全貌与基因突变类型。

研究人员通过设计靶向引物对10x Genomics 3'单细胞工作流程中的全长cDNA扩增中间产物进行半巢式PCR富集,结合PacBio长读长测序,成功捕获了KIT基因远端点突变及BCR::ABL1融合转录本。