固定样本单细胞表达谱Flex Apex（v2）

仪器运行时间：6分钟

混样：混样可以降低样本间的批次效应，最多可以将384个样本混在一个反应中进行实验，每个样本的目标细胞捕获数量最多为20000,每个反应捕获细胞数多达一百万个，后续结果中可以将不同样本的数据进行拆分，由于其独特的样本标记方式，同一个GEM中来自不同样本的多细胞数据可用，相比较Hashtag标记方法，有效数据量占比大大增加。适用于样本起始量少(最低25000个细胞)、样本数量多的解决方法。

捕获细胞数：每张芯片最多运行8个通道，可以捕获八百万个细胞

多胞率：每1000个细胞0.4%

成本：较之前版本单个样本及单个细胞成本更低

多组学分析：可同时检测表达谱、细胞表面蛋白、细胞内蛋白和sgRNA

兼容物种：人和小鼠两个物种（超过18000个基因的探针），大鼠和猴子（coming soon），其他物种可基于10x提供的方法自行定制。

兼容样本类型：固定的细胞、细胞核、组织、血液以及FFPE(石蜡)样本。其中全血固定可以很好的解决中性粒细胞脆弱易死亡等问题。兼容活率较低(大于50%活率)的细胞样本的检测。

固定样本做实验的优势：锁定其生物学状态保留脆弱细胞、样本制备方法简单、方便冻存和运输、将分析范围扩大到存档样本，从而扩展单细胞分析的可行性、降低传染性样本的实验风险。固定的样本保存时间至少1年。
分析内容：根据细胞表达谱对细胞群体进行聚类分析、识别和区分不同的细胞类型、定义新的细胞类型和细胞状态。

按照您的日程表，以前所未有的规模开展单细胞分析。Apex能够对过去因样本处理上的运输问题而无法获取的珍贵样本进行单细胞基因表达或蛋白表达分析。在样本采集点进行固定处理可保留脆弱样本的生物学特征，并大大简化工作流程，带来更多样本的宝贵见解。板式混样分析显著提升分析规模并改善样本处理。自动化的细胞微滴生成和条形码标记确保每次运行都高效可靠。

Apex可同时处理多达384个样本，在单条通道中高度一致地分析100万个细胞。对人类外周血单核细胞（PBMC）进行固定，并与人类全转录组探针组合和384个混样分析条形码进行杂交。随后按照Apex的工作流程对样本进行混合和洗涤。在单条通道中上样约145万个细胞，目标是回收100万个细胞。A.384个混样分析条形码显示出一致的转录本灵敏度。B.基因表达UMAP图显示了从单条通道中回收的969,054个PBMC的细胞聚类结果。

左图：与GEM-X Flex v1相比，Apex分析可提供质量相当或更高的数据。采用两种工作流程对分离自固定全血(A)和固定小鼠脾细胞(B)的人类PBMC进行杂交和处理。每种分析上样5,800个细胞，目标是分析4,000个细胞。与GEM-X Flex v1处理的样本相比，采用Apex(GEM-X Flex v2)处理的样本表现出更高的基因灵敏度。

右图：Apex分析在分析管和孔板格式中均能提供一致的数据质量和文库复杂度。在1.5mL分析管或96孔板中，采用Apex对解离自人类睾丸固定组织的细胞进行杂交和处理。每个样本上样5,800个细胞，目标是分析4,000个细胞。管式和板式处理的样本在基因灵敏度(A)和转录本灵敏度(B)上表现相当。

Apex分析对样本进行多组学表征，实现超高参数的多组学细胞分析。基因和蛋白表达UMAP图显示了人类PBMC细胞类型经过两种不同抗体混合物分析后的细胞聚类。染色细胞经两次洗涤后，在4°℃固定过夜。每份经过染色和固定的样本均采用Apex工作流程处理25,000个细胞(目标是分析4,000个细胞)。A.利用针对细胞表面蛋白的175种抗体(TotalSeq”“-C Human Universal CocktailV2.0,BioLegend)对人类PBMC进行染色。B.将静息(未刺激)、PMA/离子霉素(PMA/lono)刺激以及脂多糖(LPS)刺激的人类PBMC等量混合，并利用针对53种细胞表面蛋白和细胞内蛋白的抗体(MultiPro”"Human Fixed Cell lmune Profiling Antibody cocktail,Proteintech Genomics)进行染色。